Díky vlastnímu prohledávání umožňuje software McAfee výběr řady možností prohledávání. Pokud spustíte vlastní prohledávání ve výchozím nastavení, software McAfee zkontroluje všechny jednotky a složky v počítači, včetně všech síťových jednotek. Síťové jednotky však můžete vyloučit a prohledávat pouze části počítače, například důležité systémové soubory, pracovní plochu a programové soubory. Tuto možnost doporučujeme při prohledávání určitých oblastí spíše než všech oblastí v počítači.
Pomocí vlastního prohledávání můžete zkontrolovat všechny hrozby nebo pouze určité hrozby, například viry, spyware a sledovací soubory cookie. Můžete také prohledat pouze programy a dokumenty, ve kterých bylo zjištěno nejvíce virů, nicméně doporučujeme prohledat všechny typy souborů. Ve výchozím nastavení je povolena možnost používání minimálního objemu výpočetního výkonu počítače, avšak můžete ji zakázat a zvýšit tak rychlost vlastního prohledávání.