W przypadku skanowania niestandardowego w programie firmy firma McAfee można wybrać różne opcje skanowania. Domyślnie po uruchomieniu przez użytkownika skanowania niestandardowego program firmy firma McAfee sprawdza wszystkie dyski i foldery na komputerze oraz wszystkie dyski sieciowe. Można jednak wykluczyć dyski sieciowe i skanować tylko część komputera, na przykład krytyczne pliki systemowe, pulpit i pliki programów. Jest to rozwiązanie zalecane, jeśli trzeba przeskanować tyko określone — a nie wszystkie — obszary komputera.
W przypadku skanowania niestandardowego można sprawdzać występowanie wszystkich zagrożeń lub tylko niektórych z nich, np. wirusów, oprogramowania szpiegującego i śledzących plików cookie. Można również wybrać skanowanie samych programów i dokumentów, gdzie wykrywana jest większość wirusów, ale zalecamy skanowanie wszystkich typów plików. Opcja minimalnego korzystania z mocy obliczeniowej komputera jest domyślnie włączona, ale można ją wyłączyć w celu przyspieszenia skanowania niestandardowego.
