Com a varredura personalizada, a McAfee permite selecionar várias opções de varredura. Por padrão, quando você executa uma varredura personalizada, a McAfee verifica todas as unidades e pastas no computador, além das unidades de rede. No entanto, você pode excluir as unidades de rede e fazer a varredura somente nas partes do computador, como os arquivos críticos do sistema, a área de trabalho e os arquivos de programas. Isso é recomendável quando você deseja fazer a varredura em áreas específicas, em vez de todas as áreas do computador.
Com uma varredura personalizada, é possível verificar todas as ameaças ou as específicas, como vírus, spyware e cookies de rastreamento. Embora seja recomendado fazer a varredura em todos os tipos de arquivo, também é possível examinar somente programas e documentos, onde a maioria dos vírus é detectada. Uma opção para usar uma quantidade mínima da energia de processamento do computador está habilitada por padrão, mas é possível desabilitá-la para aumentar a velocidade da varredura personalizada.